More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1656 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  68.56 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  63.32 
 
 
242 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  63.64 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  56.7 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  56.7 
 
 
252 aa  261  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  59.15 
 
 
247 aa  258  8e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  54.63 
 
 
251 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  48.67 
 
 
249 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  49.78 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  48.23 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  48.23 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  48.23 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  49.78 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  48.23 
 
 
249 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  49.78 
 
 
249 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  50.22 
 
 
245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  50.22 
 
 
245 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  50.22 
 
 
249 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  50.22 
 
 
249 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
249 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  49.78 
 
 
245 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  47.79 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  46.29 
 
 
251 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  39.5 
 
 
254 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  41.6 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  39.38 
 
 
311 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  42.25 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  40.18 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  39.73 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
265 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 
260 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
261 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
258 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  39.45 
 
 
262 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  41.47 
 
 
261 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 
261 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.18 
 
 
272 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
258 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  35.47 
 
 
278 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  40.28 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  40.28 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  40.28 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  36.16 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  37.55 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.18 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.94 
 
 
490 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  36.65 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  36.36 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
256 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 
255 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  38.07 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  38.1 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  32.57 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.95 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.64 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  38.46 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.09 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.63 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  31.65 
 
 
258 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
253 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.9 
 
 
254 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1490  ABC transporter related  35.17 
 
 
278 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  36.53 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  38.14 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.07 
 
 
264 aa  111  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  38.77 
 
 
293 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  39.55 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.21 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  37.24 
 
 
281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.55 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  39.55 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.84 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  38.89 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  31.8 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  39.52 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  34.93 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  38.86 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
490 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
256 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  40.25 
 
 
271 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.03 
 
 
256 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
256 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.09 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.3 
 
 
405 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  36.99 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.45 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  33.03 
 
 
256 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>