More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1729 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  46.78 
 
 
708 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  61.74 
 
 
716 aa  913    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  65.92 
 
 
713 aa  968    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  68.2 
 
 
717 aa  1044    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
712 aa  1477    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  70.67 
 
 
716 aa  1056    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  58.18 
 
 
721 aa  881    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  65.92 
 
 
717 aa  1022    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  45.92 
 
 
714 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  43.78 
 
 
711 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  42.58 
 
 
712 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  43.28 
 
 
717 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  43.42 
 
 
711 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  43.14 
 
 
711 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  43.16 
 
 
730 aa  579  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  42.1 
 
 
710 aa  535  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 
767 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.14 
 
 
722 aa  360  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  42.2 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  36.48 
 
 
481 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  37.55 
 
 
489 aa  300  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
475 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 
470 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  41.36 
 
 
479 aa  297  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  35.43 
 
 
469 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  38.6 
 
 
470 aa  296  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  42.22 
 
 
480 aa  295  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  39.69 
 
 
486 aa  294  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  35.06 
 
 
469 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  41.53 
 
 
476 aa  292  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  35.28 
 
 
469 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  41.89 
 
 
484 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 
472 aa  290  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  42.5 
 
 
464 aa  290  9e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  37.39 
 
 
473 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  40.66 
 
 
490 aa  287  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  39.63 
 
 
481 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  38.68 
 
 
480 aa  287  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  41.35 
 
 
475 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  37.42 
 
 
470 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  40.16 
 
 
470 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  37.2 
 
 
470 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  37.2 
 
 
470 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  39 
 
 
481 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  34.06 
 
 
470 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.71 
 
 
463 aa  283  9e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 
470 aa  283  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  38 
 
 
477 aa  283  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  39.45 
 
 
481 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  35.47 
 
 
475 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  41.8 
 
 
492 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 
481 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  40.79 
 
 
475 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  40.1 
 
 
480 aa  280  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  40.15 
 
 
456 aa  280  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  39.21 
 
 
481 aa  280  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  37.66 
 
 
471 aa  279  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  30.03 
 
 
727 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  33.77 
 
 
471 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  43.16 
 
 
488 aa  277  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  36.91 
 
 
473 aa  276  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  36.19 
 
 
480 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  39.69 
 
 
469 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  33.55 
 
 
471 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  38.39 
 
 
477 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 
482 aa  275  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  38.39 
 
 
477 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40.2 
 
 
477 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  40.2 
 
 
477 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  38.71 
 
 
481 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  39.49 
 
 
478 aa  273  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  30.11 
 
 
741 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  33.55 
 
 
470 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  36.16 
 
 
475 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  39.95 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.55 
 
 
470 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  33.84 
 
 
470 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.84 
 
 
470 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.84 
 
 
470 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  38.75 
 
 
465 aa  270  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.62 
 
 
470 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  35.94 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.64 
 
 
473 aa  270  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  37.08 
 
 
522 aa  270  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.55 
 
 
480 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  270  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  35.7 
 
 
478 aa  269  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.07 
 
 
479 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  36.21 
 
 
472 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  34.96 
 
 
475 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  35.46 
 
 
475 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  35.4 
 
 
474 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  33.27 
 
 
812 aa  268  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.91 
 
 
483 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.91 
 
 
483 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.91 
 
 
483 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  33.91 
 
 
483 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.31 
 
 
484 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>