53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0783 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  52.17 
 
 
284 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  38.03 
 
 
273 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  36.62 
 
 
273 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  36.69 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  35.17 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  34.52 
 
 
273 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  34.52 
 
 
278 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  34.29 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  34.47 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  34.95 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  33.8 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  32.96 
 
 
275 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  34.83 
 
 
286 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  33.22 
 
 
284 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  29.2 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  28.57 
 
 
500 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  28.1 
 
 
284 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  30.14 
 
 
289 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  30.58 
 
 
292 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  32.08 
 
 
282 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  32.01 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  27.93 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  33.33 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.56 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  28.72 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  30 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  27.44 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  31.5 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  27.76 
 
 
283 aa  86.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  31.86 
 
 
294 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  31.98 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  25.35 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  30.11 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  29.45 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  30.25 
 
 
626 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 
625 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 
626 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  34.71 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  25.09 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.73 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  30.26 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  26.01 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  24.23 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  32.43 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  27.44 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  25.86 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  32.43 
 
 
223 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  24.6 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  27.07 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
241 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  24.81 
 
 
221 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>