More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1916 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1916  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.51 
 
 
233 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0166  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.07 
 
 
226 aa  177  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.46 
 
 
227 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.15 
 
 
263 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0098  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.85 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0190566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1280  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.29 
 
 
236 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.972743  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0106474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.04 
 
 
243 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0271  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.99 
 
 
238 aa  131  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2568  Fe-S protein-like protein  32.26 
 
 
220 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.04 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.42 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.822479  normal  0.0323586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.29 
 
 
265 aa  85.9  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101767  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1890  iron-sulfur cluster binding protein  29.17 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2229  4Fe-4S cluster binding  35.97 
 
 
324 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212465  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  33.33 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2886  iron-sulfur cluster binding protein  34.88 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4821  putative iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4033  iron-sulfur cluster binding protein  30.41 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.941411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0517  4Fe-4S cluster binding  29.03 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246101  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0503  iron-sulfur cluster binding protein  34.65 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07480  iron-sulfur cluster binding protein  33.17 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  35.77 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3210  iron-sulfur cluster binding protein  34.11 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  36 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1271  4Fe-4S cluster binding  30.69 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3280  domain of unknown function DUF1730  33.33 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.9 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1368  iron-sulfur cluster binding protein  34.65 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1629  iron-sulfur cluster binding protein  34.68 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103841  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2783  hypothetical protein  40 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314535  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.23 
 
 
362 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1058  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.46 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0372  iron-sulfur cluster binding protein  29.45 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1519  iron-sulfur cluster binding protein  32.89 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.120266  normal  0.625515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2833  iron-sulfur cluster-binding protein  33.87 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0583  hypothetical protein  49.3 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.159382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1139  domain of unknown function DUF1730  32.82 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4691  iron-sulfur cluster binding protein  29 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  29.53 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0752  domain of unknown function DUF1730  34.45 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4182  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.06 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327368  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1317  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.5 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.468365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0460  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.71 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4948  iron-sulfur cluster-binding protein  32.82 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0566  4Fe-4S cluster binding  32.82 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4756  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0149452  hitchhiker  2.27135e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1644  hypothetical protein  36.19 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0582  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.71 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0629  putative iron-sulfur cluster binding protein  28.96 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.619472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0530  4Fe-4S cluster binding  32.56 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.347974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4975  domain of unknown function DUF1730  30.92 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00114037  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0447  domain of unknown function DUF1730  30.65 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4776  putative iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 
354 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4900  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.59 
 
 
354 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.705042  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1362  domain of unknown function DUF1730  34.85 
 
 
385 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.245497  hitchhiker  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2853  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.5 
 
 
343 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0468  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.92 
 
 
380 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.385519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4952  iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.279227  normal  0.302526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.78 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2940  domain of unknown function DUF1730  37.5 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.271755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3034  domain of unknown function DUF1730  37.5 
 
 
345 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0304  iron-sulfur cluster binding protein  29.94 
 
 
326 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000115389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2396  domain of unknown function DUF1730  34.78 
 
 
364 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000413882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4944  hypothetical protein  35.83 
 
 
374 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65400  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.93 
 
 
361 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5679  iron-sulfur cluster binding protein  29.93 
 
 
361 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01260  putative iron-sulfur cluster-binding protein  28.29 
 
 
309 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3998  domain of unknown function DUF1730  29.38 
 
 
308 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0656648  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00061  hypothetical protein  30.65 
 
 
321 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  hitchhiker  0.000525225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1081  4Fe-4S cluster binding  33.07 
 
 
404 aa  62  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0517  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  28.48 
 
 
374 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2589  hypothetical protein  33.75 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1785  iron-sulfur cluster binding protein  51.61 
 
 
366 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3682  iron-sulfur cluster binding protein  27.96 
 
 
366 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.253797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3042  hypothetical protein  32 
 
 
383 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00069817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2806  hypothetical protein  27.32 
 
 
347 aa  59.7  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.578108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1910  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 
375 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1520  4Fe-4S ferredoxin protein  46.77 
 
 
438 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0107493  normal  0.24299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  32.48 
 
 
352 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1379  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 
355 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1944  putative iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 
375 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.331429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00061  hypothetical protein  28 
 
 
314 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.454167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  46.97 
 
 
380 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0672  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.16 
 
 
355 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.75883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4319  domain of unknown function DUF1730  27.17 
 
 
383 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  28.35 
 
 
312 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  32.23 
 
 
507 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00061  hypothetical protein  31.45 
 
 
324 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1392  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.62 
 
 
376 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2782  putative ferredoxin, 4Fe-4S binding protein  25.68 
 
 
372 aa  58.5  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1382  hypothetical protein  31.88 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>