143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0537 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  89.72 
 
 		 253 aa  470  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  49.8 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  33.46 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  30.92 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  30.04 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  33.59 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  30.15 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  30.15 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  28.2 
 
 		 380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  26.56 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  27.34 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  25.68 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  26.17 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  24.9 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  25.28 
 
 		 307 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  29.15 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  26.74 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  26.59 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  25.31 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  26.85 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  27.31 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  28.43 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  24.33 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  32.65 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  28.93 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  34.03 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  33.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  33.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  33.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  33.33 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  30.56 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  27.52 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  27.21 
 
 		 462 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  33.33 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  31.94 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  27.4 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  30.26 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  24.91 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0337  TatD-related deoxyribonuclease  25.45 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  25.53 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  25 
 
 		 606 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0321  TatD-related deoxyribonuclease  25.98 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  29.17 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  25.09 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0429  deoxyribonuclease  29.25 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  22.99 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  27.31 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1575  TatD-related deoxyribonuclease  24.64 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  27.01 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  40.24 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  27.34 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  40.24 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  40.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  40.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  40.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  40.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  40.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  26.79 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  25.94 
 
 		 462 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  21.43 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0194  hydrolase, TatD family protein  34.72 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0500604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  40.24 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  29.25 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  29.25 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  26.06 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.43 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  24.83 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  23.36 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  27.03 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  28.68 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  27.01 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  26.28 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  27.98 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  29.25 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  26.01 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  29.25 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  29.25 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  26.76 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  35.14 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  23.7 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  26.28 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  25.73 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  24.82 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  24.07 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  30.61 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  26.47 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1221  putative metallodependent hydrolase  26.28 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  26.32 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  32.5 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  34.09 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2027  putative metallodependent hydrolase  26.28 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  hitchhiker  0.00000164226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01096  predicted metallodependent hydrolase  26.28 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0276018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  35.14 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>