26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0337 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0337  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
280 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1575  TatD-related deoxyribonuclease  94.64 
 
 
280 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1051  TatD-related deoxyribonuclease  95.36 
 
 
280 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0185  TatD-related deoxyribonuclease  79.29 
 
 
280 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0638  TatD-related deoxyribonuclease  64.87 
 
 
283 aa  376  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0622  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  45.07 
 
 
280 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1153  TatD-related deoxyribonuclease  41.52 
 
 
282 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1671  TatD-related deoxyribonuclease  38.79 
 
 
275 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387912  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1240  TatD-related deoxyribonuclease  37.1 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.237425  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0826  TatD-related deoxyribonuclease  40.28 
 
 
276 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.921245  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1878  TatD-related deoxyribonuclease  39.52 
 
 
281 aa  182  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.211248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2047  TatD-related deoxyribonuclease  36.84 
 
 
283 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1888  TatD-related deoxyribonuclease  36.43 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0832  hypothetical protein  31.91 
 
 
273 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1934  TatD-related deoxyribonuclease  34.49 
 
 
285 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0403  TatD-related deoxyribonuclease  34.95 
 
 
290 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2749  TatD-related deoxyribonuclease  34.62 
 
 
280 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2091  TatD-related deoxyribonuclease  31.9 
 
 
285 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0405  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0370  TatD-related deoxyribonuclease  34.88 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1276  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 
286 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000191053  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1844  TatD-related deoxyribonuclease  30.22 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0854198 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0474  TatD-related deoxyribonuclease  30.69 
 
 
289 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000311622  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  25.45 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1017  putative deoxyribonuclease, TatD family  25.4 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18871  TatD family deoxyribonuclease  25.4 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>