23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0405 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0405  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 290 aa  567  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1844  TatD-related deoxyribonuclease  83.69 
 
 		 286 aa  470  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0854198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1276  TatD-related deoxyribonuclease  82.98 
 
 		 286 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000191053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2091  TatD-related deoxyribonuclease  78.52 
 
 		 285 aa  455  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0474  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000311622  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0185  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1575  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0337  TatD-related deoxyribonuclease  30.82 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1051  TatD-related deoxyribonuclease  30.58 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1888  TatD-related deoxyribonuclease  34.66 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1240  TatD-related deoxyribonuclease  36.97 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.237425  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0832  hypothetical protein  35.38 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0622  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.97 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0638  TatD-related deoxyribonuclease  28.07 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1153  TatD-related deoxyribonuclease  36.54 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0826  TatD-related deoxyribonuclease  29.12 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.921245  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1671  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1878  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.211248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0370  TatD-related deoxyribonuclease  30.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2749  TatD-related deoxyribonuclease  33.1 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2047  TatD-related deoxyribonuclease  32.62 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1934  TatD-related deoxyribonuclease  31.67 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0403  TatD-related deoxyribonuclease  33.21 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>