23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1240 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1240  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.237425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1671  TatD-related deoxyribonuclease  68 
 
 
275 aa  388  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.387912  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0826  TatD-related deoxyribonuclease  61.59 
 
 
276 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.921245  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1888  TatD-related deoxyribonuclease  66.18 
 
 
275 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0832  hypothetical protein  54.51 
 
 
273 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0622  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  50 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1153  TatD-related deoxyribonuclease  47.39 
 
 
282 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2047  TatD-related deoxyribonuclease  50.18 
 
 
283 aa  249  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2749  TatD-related deoxyribonuclease  47.5 
 
 
280 aa  228  8e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1878  TatD-related deoxyribonuclease  47.06 
 
 
281 aa  223  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.211248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0403  TatD-related deoxyribonuclease  48.91 
 
 
290 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1934  TatD-related deoxyribonuclease  45.76 
 
 
285 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225574  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1575  TatD-related deoxyribonuclease  37.19 
 
 
280 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0337  TatD-related deoxyribonuclease  37.1 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1051  TatD-related deoxyribonuclease  37.1 
 
 
280 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0185  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 
280 aa  175  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0638  TatD-related deoxyribonuclease  34.74 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1844  TatD-related deoxyribonuclease  36.01 
 
 
286 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0854198 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1276  TatD-related deoxyribonuclease  36.59 
 
 
286 aa  149  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000191053  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0405  TatD-related deoxyribonuclease  36.97 
 
 
290 aa  148  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.487045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0370  TatD-related deoxyribonuclease  32.23 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2091  TatD-related deoxyribonuclease  36.2 
 
 
285 aa  143  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0474  TatD-related deoxyribonuclease  31.56 
 
 
289 aa  132  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000311622  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>