34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0499 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  100 
 
 		 285 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  38.83 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  36.21 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  38.13 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  31.07 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  27 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  27.09 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  27.06 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  27.84 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  23.51 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  26 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.1 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19160  site-specific recombinase XerD  25.18 
 
 		 369 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0191087  normal  0.520558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 326 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.6 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  24.39 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.75 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.14 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  26.09 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  25.86 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.59 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  25.75 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0018  site-specific tyrosine recombinase XerS  22.93 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000485096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  25.86 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.02 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  25.97 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>