41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3994 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3994  heme exporter protein D  100 
 
 		 66 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.692189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1380  heme exporter protein CcmD  48.15 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0042  Heme exporter protein D (CcmD)  57.5 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1515  heme exporter protein D (CcmD)  44.44 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1642  heme exporter protein D  40 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.752809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1211  hypothetical protein  47.83 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.284082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1367  heme exporter protein D  40 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0187  Heme exporter protein D (CcmD)  31.75 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000124627  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3730  Heme exporter protein D (CcmD)  33.87 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0522398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0420  heme exporter protein CcmD, putative  38.89 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002844  cytochrome c-type biogenesis protein CcmD interacts with CcmCE  38.81 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3021  Heme exporter protein D (CcmD)  42.19 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4027  heme exporter protein CcmD  33.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.385371  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0242  heme exporter protein CcmD  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0295502  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  33.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0178152  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  33.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0435599  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0225  Heme exporter protein D (CcmD)  33.87 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0709378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1547  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.594579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0176  Heme exporter protein D (CcmD)  36.36 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  32.26 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0464589  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03071  heme exporter protein CcmD  44.83 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0260  heme exporter protein CcmD  32.73 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3849  heme exporter protein CcmD  43.4 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3632  heme exporter protein CcmD  41.82 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0223  Heme exporter protein D (CcmD)  32.26 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45340  putative heme exporter protein  43.4 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0228  Heme exporter protein D (CcmD)  32.26 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.102118  unclonable  0.0000000000309082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2788  Heme exporter protein D (CcmD)  37.74 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.90473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2958  Heme exporter protein D  36.54 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1031  heme exporter protein CcmD  70.83 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3253  Heme exporter protein D (CcmD)  38.18 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4662  heme exporter protein CcmD  32.73 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270575  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4290  heme exporter protein D (CcmD)  32.26 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000529225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0212  Heme exporter protein D (CcmD)  27.42 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03132  heme exporter protein D  35.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1580  Heme exporter protein D  44.44 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4001  heme exporter protein CcmD  44.19 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3650  heme exporter protein CcmD  35.85 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.649562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3572  Heme exporter protein D (CcmD)  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0932197  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0890  heme exporter protein CcmD  34.04 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0921  heme exporter protein CcmD  34.04 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>