75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3614 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  100 
 
 
649 aa  1313    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  39.12 
 
 
697 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  78.05 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  72.25 
 
 
700 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  66.83 
 
 
478 aa  294  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  70.53 
 
 
479 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  61.24 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  63.44 
 
 
394 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  52.81 
 
 
500 aa  249  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  56.1 
 
 
517 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  52.05 
 
 
517 aa  236  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  52.47 
 
 
522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  52.22 
 
 
498 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  47.15 
 
 
497 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  44.71 
 
 
585 aa  195  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  44.49 
 
 
660 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  44.61 
 
 
521 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  45.1 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  42.98 
 
 
522 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  46.31 
 
 
521 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  46.24 
 
 
724 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  43.54 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  28.67 
 
 
638 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  41.87 
 
 
514 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  42.36 
 
 
509 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  43.41 
 
 
551 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  47.03 
 
 
512 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.4 
 
 
569 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  48.11 
 
 
518 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  47.59 
 
 
401 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  46.84 
 
 
405 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  42.86 
 
 
522 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  44.62 
 
 
596 aa  168  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  41.04 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  42.36 
 
 
544 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  45.79 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  42.71 
 
 
524 aa  158  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  42.33 
 
 
499 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  42.33 
 
 
499 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  40.59 
 
 
599 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  43.23 
 
 
821 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  42.47 
 
 
1117 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  40.49 
 
 
781 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  39.61 
 
 
514 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  40.74 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  39.68 
 
 
802 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  34.62 
 
 
542 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  32.28 
 
 
585 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  39.15 
 
 
644 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  38.83 
 
 
690 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  34.59 
 
 
734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  36.36 
 
 
402 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  30.49 
 
 
686 aa  94.4  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  29.21 
 
 
509 aa  84  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.71 
 
 
509 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.71 
 
 
509 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.33 
 
 
740 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.43 
 
 
740 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.32 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  26.37 
 
 
392 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  26.37 
 
 
392 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  26.24 
 
 
391 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.18 
 
 
392 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  31.25 
 
 
474 aa  57.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  30.23 
 
 
405 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  24.04 
 
 
386 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  24.44 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  28.04 
 
 
388 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  27.1 
 
 
386 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  28.18 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  23.53 
 
 
501 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  27.82 
 
 
485 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  28.44 
 
 
387 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  29.1 
 
 
534 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  28.18 
 
 
388 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>