28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2237 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2237  putative DNA repair ATPase  100 
 
 		 820 aa  1639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2558  putative DNA repair ATPase  74.75 
 
 		 818 aa  1190    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.591835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1571  putative DNA repair ATPase  59.54 
 
 		 822 aa  884    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.490564  normal  0.107556 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6786  putative ATPase involved in DNA repair  38.2 
 
 		 773 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1637  putative DNA repair ATPase  35.76 
 
 		 774 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5278  hypothetical protein  35.88 
 
 		 774 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366308  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6218  putative DNA repair ATPase  36.92 
 
 		 757 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.657002 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4320  putative DNA repair ATPase  34.8 
 
 		 810 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480369  normal  0.867818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3731  putative DNA repair ATPase  34.58 
 
 		 808 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.835682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.69 
 
 		 1031 aa  69.3  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  30.28 
 
 		 1023 aa  58.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  29.43 
 
 		 910 aa  57.4  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  29.51 
 
 		 1019 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  24.39 
 
 		 1007 aa  52  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  26.22 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.56 
 
 		 1003 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  25.69 
 
 		 1007 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  24.41 
 
 		 859 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  27.51 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  26.09 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.57 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  27.86 
 
 		 1008 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  27.21 
 
 		 1008 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  25.11 
 
 		 1114 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  29.35 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  31.88 
 
 		 859 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  28.03 
 
 		 1099 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  28.98 
 
 		 1137 aa  44.3  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>