More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2021 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 540 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 540 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1080  L-aspartate oxidase  68.27 
 
 		 528 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0956  L-aspartate oxidase  69.5 
 
 		 525 aa  726    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  60.54 
 
 		 530 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  62.64 
 
 		 534 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  70.31 
 
 		 533 aa  749    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  63.31 
 
 		 533 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  62.45 
 
 		 534 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  71.26 
 
 		 533 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0791  L-aspartate oxidase  69.45 
 
 		 528 aa  734    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357674  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  59.2 
 
 		 550 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  61.11 
 
 		 532 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  60.49 
 
 		 537 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  62.93 
 
 		 538 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 		 540 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  62.55 
 
 		 538 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  62.84 
 
 		 539 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 535 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2017  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 541 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.807399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2529  L-aspartate oxidase  69.9 
 
 		 528 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  62.36 
 
 		 538 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  61.6 
 
 		 533 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 525 aa  1081    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  60.88 
 
 		 537 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  60.76 
 
 		 537 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1106  L-aspartate oxidase  62.41 
 
 		 552 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.927314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  70.34 
 
 		 528 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  69.27 
 
 		 541 aa  739    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  60.88 
 
 		 537 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  69.36 
 
 		 529 aa  736    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  68.74 
 
 		 533 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  63.79 
 
 		 539 aa  689    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  61.81 
 
 		 538 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  62.64 
 
 		 534 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5836  L-aspartate oxidase  70.29 
 
 		 528 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3151  L-aspartate oxidase  70.61 
 
 		 532 aa  748    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 570 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2422  L-aspartate oxidase  69.71 
 
 		 528 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266314  hitchhiker  0.00145144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 570 aa  732    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  74.71 
 
 		 532 aa  806    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0582  L-aspartate oxidase  69.58 
 
 		 532 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  59.28 
 
 		 533 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  61.6 
 
 		 533 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 570 aa  732    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  60.95 
 
 		 537 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 540 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  70.97 
 
 		 534 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 570 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 533 aa  732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 		 540 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  62.83 
 
 		 534 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  60.69 
 
 		 537 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  65.03 
 
 		 542 aa  697    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  67.82 
 
 		 536 aa  703    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  59.12 
 
 		 555 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  61.22 
 
 		 536 aa  656    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  69.29 
 
 		 538 aa  758    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  69.29 
 
 		 538 aa  758    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  67.24 
 
 		 541 aa  735    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  70.55 
 
 		 532 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  60.87 
 
 		 537 aa  665    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  60.04 
 
 		 545 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  61.6 
 
 		 545 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  69.92 
 
 		 535 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  60.99 
 
 		 540 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  60.65 
 
 		 536 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1551  L-aspartate oxidase  63.08 
 
 		 530 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.297735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  70.27 
 
 		 523 aa  748    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1893  L-aspartate oxidase  69.9 
 
 		 528 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  60.61 
 
 		 540 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  68.87 
 
 		 570 aa  732    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  62.48 
 
 		 538 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  60.15 
 
 		 533 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  60.8 
 
 		 540 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  61.19 
 
 		 540 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  60.68 
 
 		 537 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  60.68 
 
 		 537 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1338  L-aspartate oxidase  62.79 
 
 		 544 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  60.38 
 
 		 538 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  60.99 
 
 		 540 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2551  L-aspartate oxidase  69.71 
 
 		 528 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  62.55 
 
 		 538 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  62.41 
 
 		 543 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2504  L-aspartate oxidase  69.9 
 
 		 528 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0764  L-aspartate oxidase  62.86 
 
 		 552 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.130932 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  62.83 
 
 		 535 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  61.71 
 
 		 539 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  60.87 
 
 		 537 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  70.75 
 
 		 533 aa  753    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  60.42 
 
 		 539 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2816  L-aspartate oxidase  68.98 
 
 		 529 aa  726    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0796143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  60.88 
 
 		 537 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  60.08 
 
 		 535 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  60.34 
 
 		 539 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  59.46 
 
 		 543 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  60.42 
 
 		 540 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  64.23 
 
 		 542 aa  677    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  60.27 
 
 		 536 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3840  L-aspartate oxidase  67.24 
 
 		 529 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>