61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2180 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.42 
 
 
317 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.37 
 
 
315 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.9 
 
 
319 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  57.37 
 
 
318 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.17 
 
 
324 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
315 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  50.32 
 
 
324 aa  338  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.25 
 
 
333 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  38.58 
 
 
339 aa  256  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  40.62 
 
 
339 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37 
 
 
333 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  37.89 
 
 
328 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  37.89 
 
 
328 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  33.86 
 
 
327 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  34.17 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.86 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.56 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.526116  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.16 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.59 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
355 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  23.7 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.36 
 
 
334 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  26.72 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.32 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  22.57 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.28 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.88 
 
 
333 aa  46.2  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  22.83 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.35 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  27.5 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.15 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2209  hypothetical protein  24.56 
 
 
514 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  24.26 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1504  NAD dependent protein  25.86 
 
 
328 aa  43.5  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.61 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.93 
 
 
358 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1235  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30.26 
 
 
322 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.747761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.05 
 
 
196 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 
412 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  25.6 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3638  UDP-glucose 4-epimerase, putative  21.56 
 
 
326 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2505  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.17 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000697027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2107  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.17 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 
346 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.4 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>