43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0037 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  94.12 
 
 
88 bp  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  89.29 
 
 
84 bp  95.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  97.78 
 
 
87 bp  73.8  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  97.44 
 
 
86 bp  69.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  97.37 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  95 
 
 
83 bp  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  95.24 
 
 
89 bp  60  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  97.22 
 
 
89 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  85.92 
 
 
83 bp  54  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  91.67 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  89.58 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  94.44 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  89.74 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  90.7 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  89.74 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  96.3 
 
 
92 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  91.18 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  92.11 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>