46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5191 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1114  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  78.9 
 
 
437 aa  727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.783576  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3127  SAF domain-containing protein  74.13 
 
 
437 aa  681    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0203233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5191  SAF domain protein  100 
 
 
437 aa  895    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2145  SAF domain protein  65.59 
 
 
453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.342497  hitchhiker  0.000671283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0572  SAF domain protein  61.45 
 
 
429 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00218349  normal  0.0588156 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3191  SAF domain protein  61.12 
 
 
428 aa  539  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124464  hitchhiker  0.000220219 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2179  SAF domain-containing protein  61.47 
 
 
449 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0025  NAD(P)-dependent oxidoreductase  60.18 
 
 
449 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1654  SAF domain-containing protein  60.18 
 
 
449 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4541  SAF domain-containing protein  54.3 
 
 
441 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10759  normal  0.775728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3777  SAF domain protein  35.25 
 
 
430 aa  253  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000406038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3688  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  36.74 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4118  SAF domain-containing protein  34.42 
 
 
439 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.015504  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2231  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  35.83 
 
 
443 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0910  putative oxidoreductase  36.03 
 
 
438 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0970  oxidoreductase, putative  36.03 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0066  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
418 aa  226  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1208  homoserine dehydrogenase  35.62 
 
 
424 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2037  homoserine dehydrogenase  36.32 
 
 
418 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1387  homoserine dehydrogenase NAD-binding  34.88 
 
 
438 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1106  putative oxidoreductase, NAD-binding  34.19 
 
 
441 aa  220  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.489404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1504  dihydrodipicolinate reductase  29.79 
 
 
430 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000626794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1545  SAF domain protein  31.86 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2314  SAF domain-containing protein  31.35 
 
 
446 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673727  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0563  SAF domain-containing protein  33.41 
 
 
452 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585583  normal  0.350969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6900  SAF domain protein  32.48 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1559  SAF domain-containing protein  33.95 
 
 
447 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.712401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3096  SAF domain-containing protein  32.22 
 
 
455 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283143  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3724  SAF domain protein  32.46 
 
 
454 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1155  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
396 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3249  hypothetical protein  30.86 
 
 
445 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0880  SAF domain-containing protein  30.13 
 
 
458 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4870  SAF domain-containing protein  31.63 
 
 
453 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0758673  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1201  hypothetical protein  31.18 
 
 
434 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259827  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1550  SAF domain-containing protein  31.49 
 
 
446 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000710074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2547  SAF domain-containing protein  30.42 
 
 
452 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395331  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1713  oxidoreductase-like  29.78 
 
 
452 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138694  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2407  homoserine dehydrogenase NAD-binding  30.47 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3473  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0794903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0296  SAF domain protein  32.16 
 
 
451 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 
450 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4089  dihydrodipicolinate reductase  32.01 
 
 
435 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2334  homoserine dehydrogenase, NAD-binding protein  27.37 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal  0.115253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3388  SAF domain-containing protein  23.1 
 
 
467 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3729  SAF domain protein  25.22 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3141  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  25.88 
 
 
455 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>