More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3604 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3604  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 444 aa  881    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 480 aa  359  7e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 471 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.42 
 
 		 495 aa  352  5e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 480 aa  349  5e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 466 aa  349  5e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 492 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 474 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 535 aa  346  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 498 aa  346  5e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 477 aa  342  8e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 491 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 494 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 473 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 482 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 466 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 490 aa  335  9e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 471 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 466 aa  329  5.0000000000000004e-89  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 469 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 474 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 469 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 474 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 472 aa  322  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 474 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 474 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 463 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 469 aa  318  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 469 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 509 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 469 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>