More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2445 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  100 
 
 		 347 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  47.7 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.45 
 
 		 346 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  41.48 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  41.48 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.48 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  41.48 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  41.48 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  41.48 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  41.76 
 
 		 347 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  40.91 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.88 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.75 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.46 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.09 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  34.1 
 
 		 341 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3068  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.99 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4382  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5063  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.99 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392538  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5797  alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3580  hypothetical protein  33.52 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.885973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.78 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6746  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.14 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.81 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.53 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  34.41 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1653  putative D-xylulose reductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1076  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  35.26 
 
 		 347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1235  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0068  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0351  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.66 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.13 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5833  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.55 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.119386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  34.9 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.63 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.56 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.85 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  33.9 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  31.59 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  37.3 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.35 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16590  xylitol dehydrogenase, zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  33.62 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02960  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  32.95 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  36.34 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  33.03 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.24 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  32.35 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  31.22 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  32.3 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 		 362 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.14 
 
 		 362 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.58 
 
 		 346 aa  185  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.11 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0551  D-xylulose reductase  33.43 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  34.51 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  33.06 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  33.54 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  34.16 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.73 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.124496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.85 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.53 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.13 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 347 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  32.85 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  32.95 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.580046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  32.56 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  32.46 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  32.56 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  32.46 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  31.92 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.74 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14560  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.16 
 
 		 352 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0972559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  30.09 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  38.78 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  31.16 
 
 		 360 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 583 aa  172  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>