136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0597 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 
326 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.88 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.88 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  42.19 
 
 
374 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 
90 aa  57  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  42.03 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
77 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  39.06 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  34.85 
 
 
65 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.62 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.82 
 
 
329 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  34.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  31.82 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.36 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.5 
 
 
331 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  40.58 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  40.58 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.58 
 
 
70 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1662  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 
66 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000426635  hitchhiker  0.000995096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
68 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14361  hypothetical protein  39.13 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1158  sulfur transfer protein for thiamine biosynthesis  38.46 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2027  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2025  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2320  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.608129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2436  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0745874  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1925  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.76 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  34.33 
 
 
67 aa  43.5  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0808  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  26.56 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>