58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0467 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  40.08 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  33.16 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  33.5 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  27.05 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.91 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.16 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  30.77 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  26.26 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  27.36 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  23.86 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  26.38 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  24.35 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  29.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.32 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  25.69 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  27.27 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  26.74 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  28.57 
 
 		 200 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42250  type III secretion system protein  27.66 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  25.16 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  22.83 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.31 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  25.26 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2434  type III secretion system protein  26.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  21.74 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  25.56 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.36 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  25.87 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  24.1 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  26.14 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  23.7 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  21.84 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  24.14 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.6 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  25.79 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  23.67 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  22.49 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2268  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2356  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 		 200 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.576536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2561  flagellar assembly protein FliH  21.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00219056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  24.29 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1392  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  21.5 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0445381  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0342  flagellar assembly protein H  23.42 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0365  flagellar assembly protein H  23.42 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3746  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  22.16 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212499  hitchhiker  0.00667574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  21.52 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2465  flagellar assembly protein FliH  20.95 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.000780406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  23.72 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  22.01 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0040  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  21.93 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4745  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.08 
 
 		 209 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.528631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  22.64 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  20.86 
 
 		 224 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1270  hypothetical protein  28.14 
 
 		 229 aa  42  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.96305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4223  HrpE/YscL family type III secretion apparatus protein  23.08 
 
 		 209 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1643  flagellar assembly protein H  22.64 
 
 		 276 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>