34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2276 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  100 
 
 
880 aa  1794    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2278  hypothetical protein  89.38 
 
 
631 aa  1100    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.262759  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  24.46 
 
 
856 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  25.38 
 
 
947 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  25.38 
 
 
947 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  25.23 
 
 
947 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  24.49 
 
 
852 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  26.54 
 
 
953 aa  157  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  26.52 
 
 
870 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  24.85 
 
 
893 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  23.17 
 
 
853 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  23.22 
 
 
858 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  23.22 
 
 
858 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  24.56 
 
 
862 aa  128  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  23.31 
 
 
875 aa  127  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02058  hypothetical protein  24.77 
 
 
832 aa  101  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3481  hypothetical protein  21.37 
 
 
671 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.278924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  23.24 
 
 
1160 aa  76.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  30.11 
 
 
945 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  29.73 
 
 
960 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  26.96 
 
 
944 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  29.28 
 
 
966 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0113  hypothetical protein  29.23 
 
 
1085 aa  57  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  30.86 
 
 
1013 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0196  hypothetical protein  26.49 
 
 
1126 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312925  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  26.49 
 
 
944 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  26.49 
 
 
945 aa  51.2  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  26.49 
 
 
944 aa  51.2  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  26.49 
 
 
944 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3502  hypothetical protein  26.37 
 
 
1132 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.990422  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1904  hypothetical protein  25.08 
 
 
1142 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.185676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  24.4 
 
 
1007 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  37.97 
 
 
887 aa  45.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2535  hypothetical protein  26.26 
 
 
1146 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>