More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5959 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 376 aa  783    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  46.05 
 
 		 378 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  46.01 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  43.88 
 
 		 376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  43.72 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.45 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  28.46 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.91 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 408 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.17 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  35.21 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.77 
 
 		 351 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 386 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  34.26 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25.47 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 437 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  28.37 
 
 		 373 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  24.73 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 420 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.95 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  31.16 
 
 		 430 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 380 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.26 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.6 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.6 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  25.87 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>