66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5792 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5792  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  206  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2549  hypothetical protein  61.39 
 
 
103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3776  hypothetical protein  51.52 
 
 
108 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000562489  hitchhiker  0.00860307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4140  hypothetical protein  62 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.193534  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5078  hypothetical protein  48.39 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.322327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0575  hypothetical protein  41.41 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3918  hypothetical protein  44.21 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0276  hypothetical protein  38.61 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00194964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5249  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5647  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5078  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000186097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5095  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5492  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5190  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5576  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5526  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5520  hypothetical protein  37 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5431  hypothetical protein  38.95 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1502  hypothetical protein  35.63 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1261  hypothetical protein  42.05 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1353  hypothetical protein  36.46 
 
 
120 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.139683  normal  0.153644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3957  hypothetical protein  33.72 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00169792  normal  0.0939077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3170  hypothetical protein  35.71 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1262  hypothetical protein  39.53 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3578  hypothetical protein  32.95 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1889  hypothetical protein  35.11 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1237  hypothetical protein  39.56 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000614631  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2198  membrane-associated protein  32.26 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1315  hypothetical protein  37.08 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0282  hypothetical protein  32.97 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1106  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.076779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0231  hypothetical protein  31.03 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4848  hypothetical protein  28.72 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11958  hypothetical protein  34.88 
 
 
89 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2341  hypothetical protein  42.05 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281359  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3863  hypothetical protein  44.94 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.778203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3937  hypothetical protein  44.94 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1650  hypothetical protein  37.78 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0214311  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4762  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0980147  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3849  hypothetical protein  44.94 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3536  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000435682  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4327  hypothetical protein  31.87 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.31741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1531  hypothetical protein  32.22 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883847  normal  0.0165491 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5441  hypothetical protein  28.72 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07670  hypothetical protein  31.91 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10496  normal  0.422177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5421  hypothetical protein  28.72 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226004  normal  0.0109981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0829  hypothetical protein  34.44 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.45042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24650  hypothetical protein  28.12 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.757383  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5661  hypothetical protein  30.56 
 
 
100 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0214  hypothetical protein  37.08 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2016  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1816  hypothetical protein  26.6 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000551329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5176  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2651  hypothetical protein  35.48 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2129  hypothetical protein  33.7 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2847  hypothetical protein  32.22 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3889  hypothetical protein  30.34 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.993431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3073  hypothetical protein  27.72 
 
 
143 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.116175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1333  hypothetical protein  34.09 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00349105  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0054  hypothetical protein  25.84 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6084  hypothetical protein  32.65 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5399  hypothetical protein  29.09 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3347  hypothetical protein  26.37 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4023  hypothetical protein  26.67 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653706  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0753  hypothetical protein  28.28 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0998951  normal  0.0100681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1951  inner membrane protein  30.11 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0518016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>