More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3053 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 450 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  53.86 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  41.86 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  45.23 
 
 		 423 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.87 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.15 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.36 
 
 		 605 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.37 
 
 		 607 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 		 868 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  31.56 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  33.5 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  33.5 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.35 
 
 		 624 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 890 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 892 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  29.57 
 
 		 892 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 890 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 894 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.33 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.57 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30.74 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 895 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  29.83 
 
 		 890 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  27.55 
 
 		 817 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  28.79 
 
 		 892 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  27.07 
 
 		 868 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 860 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  28.15 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  27.73 
 
 		 853 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 851 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.92 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.17 
 
 		 554 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 855 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 858 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 855 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 855 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  29.2 
 
 		 854 aa  99  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  28.62 
 
 		 850 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  26.13 
 
 		 854 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 872 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 855 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  26.72 
 
 		 853 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  26.65 
 
 		 855 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  26.22 
 
 		 860 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  26.54 
 
 		 846 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 		 852 aa  97.8  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 851 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 		 882 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  29.32 
 
 		 854 aa  96.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 882 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  28.18 
 
 		 858 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  28.5 
 
 		 852 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  28.43 
 
 		 851 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  28.43 
 
 		 851 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 882 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.79 
 
 		 586 aa  95.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 		 859 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  25.77 
 
 		 846 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.82 
 
 		 596 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  31.28 
 
 		 855 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  26.69 
 
 		 892 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 910 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  29.03 
 
 		 910 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  28.2 
 
 		 820 aa  92.8  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07480  DNA mismatch repair protein MSH2, putative  28.83 
 
 		 965 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.65 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.65 
 
 		 536 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  26.23 
 
 		 854 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 882 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  25.92 
 
 		 853 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  30.53 
 
 		 855 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 857 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  27.13 
 
 		 859 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  26.13 
 
 		 854 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.46 
 
 		 615 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.98 
 
 		 555 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  30.53 
 
 		 855 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 859 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  26.4 
 
 		 862 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 		 882 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  30.84 
 
 		 857 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  29.38 
 
 		 887 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  29.22 
 
 		 601 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 855 aa  90.9  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 		 870 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10621  DNA mismatch repair protein Msh2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09850)  27.78 
 
 		 945 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  27.18 
 
 		 855 aa  90.1  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  28.02 
 
 		 862 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 		 872 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  27.67 
 
 		 924 aa  90.1  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>