More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2667 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 442 aa  910    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  53.86 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  46.21 
 
 		 423 aa  362  6e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  40.05 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.05 
 
 		 443 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.98 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.16 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35 
 
 		 605 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.1 
 
 		 626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  32.66 
 
 		 595 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  32.66 
 
 		 595 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.1 
 
 		 593 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 		 855 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  28.91 
 
 		 868 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.82 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.69 
 
 		 554 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  28.36 
 
 		 601 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.97 
 
 		 624 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.15 
 
 		 615 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 850 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 860 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  26.64 
 
 		 853 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  26.46 
 
 		 853 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  28.69 
 
 		 874 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32 
 
 		 590 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  27.72 
 
 		 854 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.55 
 
 		 597 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.55 
 
 		 597 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  31.47 
 
 		 596 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  29.7 
 
 		 594 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 		 855 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 		 855 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 		 855 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.17 
 
 		 555 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 		 855 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.82 
 
 		 586 aa  96.7  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  26.09 
 
 		 855 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 853 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 854 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 852 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 860 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  29.1 
 
 		 883 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  27.49 
 
 		 892 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  27.69 
 
 		 854 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  32 
 
 		 590 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  29.13 
 
 		 927 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 		 872 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 846 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 910 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  29.55 
 
 		 846 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  33.33 
 
 		 870 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.18 
 
 		 897 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.28 
 
 		 601 aa  93.2  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  28.4 
 
 		 905 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  29.84 
 
 		 881 aa  93.2  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  26.28 
 
 		 856 aa  93.2  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 870 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  30.5 
 
 		 870 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  27.52 
 
 		 858 aa  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.46 
 
 		 900 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  30.04 
 
 		 859 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  26.09 
 
 		 862 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 884 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 884 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  25.55 
 
 		 854 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  25.3 
 
 		 881 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.51 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  33 
 
 		 868 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  27.6 
 
 		 860 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.51 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  29.04 
 
 		 854 aa  90.5  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  29.13 
 
 		 817 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 		 872 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  29.9 
 
 		 521 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  28.75 
 
 		 557 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 853 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 		 893 aa  90.1  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  30.52 
 
 		 867 aa  90.1  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  29.69 
 
 		 521 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  26.83 
 
 		 862 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  25.18 
 
 		 852 aa  89.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 851 aa  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  27.1 
 
 		 871 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 853 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  32.78 
 
 		 872 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  28.03 
 
 		 922 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 		 872 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  27.1 
 
 		 859 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  29.34 
 
 		 882 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  27.72 
 
 		 910 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  31.34 
 
 		 863 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  27.97 
 
 		 928 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  27.89 
 
 		 820 aa  87.8  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  26.62 
 
 		 956 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>