68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2502 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  100 
 
 		 557 aa  1144    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1491  hypothetical protein  31.13 
 
 		 587 aa  236  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.287152  normal  0.0494428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4498  hypothetical protein  29.34 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0038  amine oxidase  24.28 
 
 		 654 aa  94  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1755  hypothetical protein  23.18 
 
 		 686 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6673  hypothetical protein  32.02 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.792447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  21.94 
 
 		 491 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.24 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.24 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  21.73 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.69 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.88 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  21.88 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.27 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  21.17 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.69 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.06 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.22 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  21.51 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.28 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  21.92 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  20.48 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  20.48 
 
 		 490 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  20.45 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.43 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  20.3 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  20.86 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  20.45 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  20.45 
 
 		 482 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  20.45 
 
 		 482 aa  54.7  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  21.7 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  38.16 
 
 		 488 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  43.4 
 
 		 682 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  21.8 
 
 		 687 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  37.8 
 
 		 578 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  35.37 
 
 		 576 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  22.87 
 
 		 698 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 494 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  37.74 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  47.73 
 
 		 688 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  47.73 
 
 		 689 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  41.51 
 
 		 687 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 510 aa  47  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  22.62 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  39.71 
 
 		 572 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0962  monooxygenase, flavin-binding family protein  36.54 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5057  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5436  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5145  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1040  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 503 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  39.73 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  24.28 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  43.33 
 
 		 580 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1819  flavin-containing monooxygenase FMO  37.74 
 
 		 505 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5690  putative flavin-containing monooxygenase  36.36 
 
 		 486 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0569686  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  48.89 
 
 		 387 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  43.59 
 
 		 482 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  26.06 
 
 		 523 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  48.89 
 
 		 387 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  40 
 
 		 562 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  36.54 
 
 		 491 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  24.18 
 
 		 492 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  25.58 
 
 		 621 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  29.33 
 
 		 470 aa  43.9  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1542  putative monooxygenase  37.25 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.906051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  28.87 
 
 		 620 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  44.26 
 
 		 570 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0374  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  40.91 
 
 		 495 aa  43.5  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>