More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1162 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1162  enolase  100 
 
 
430 aa  880    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  71.36 
 
 
427 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  71.19 
 
 
423 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 
431 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  69.86 
 
 
426 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.01 
 
 
430 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  67.3 
 
 
430 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.72 
 
 
431 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 
428 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
430 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.87 
 
 
427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  64.79 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
433 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.11 
 
 
429 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  65.13 
 
 
437 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.02 
 
 
426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 
434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 
430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  67.3 
 
 
430 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
437 aa  568  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  66.27 
 
 
428 aa  568  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
425 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
431 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
428 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
437 aa  566  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
425 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
428 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 
437 aa  565  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  65.41 
 
 
435 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 
425 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 
437 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  64.54 
 
 
432 aa  565  1e-160  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
431 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  64.06 
 
 
437 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.01 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  67.38 
 
 
425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 
425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
429 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 
428 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  66.35 
 
 
428 aa  558  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
427 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 
431 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 
431 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  63.49 
 
 
431 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 
433 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.51 
 
 
424 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
434 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
425 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
427 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
425 aa  557  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
434 aa  557  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
427 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
434 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  61.12 
 
 
428 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
426 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
425 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 
427 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
426 aa  551  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
426 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
433 aa  551  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
426 aa  548  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  62.97 
 
 
431 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.89 
 
 
427 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
430 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.67 
 
 
422 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  61.1 
 
 
427 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
433 aa  550  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  63.06 
 
 
422 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
434 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.02 
 
 
429 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  62.74 
 
 
427 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
427 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5238  enolase  63.26 
 
 
425 aa  545  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  60 
 
 
433 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
427 aa  546  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
427 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  65.72 
 
 
426 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  61.08 
 
 
428 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
435 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
428 aa  541  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 
428 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  62.33 
 
 
426 aa  542  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 
431 aa  541  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
425 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>