More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0949 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0949  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 433 aa  889    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.67 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.81 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  63.34 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  63.34 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  63.74 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  63.34 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  60.97 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  63.34 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  62.07 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  61.07 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  60.37 
 
 		 431 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  60.56 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.43 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  64.04 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  61.31 
 
 		 429 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  61.54 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  63.92 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  61.7 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  61.24 
 
 		 435 aa  532  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.48 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  61.15 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 432 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.25 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.56 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  61.48 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  61.48 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  59.68 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  61.38 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  61.15 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  60.79 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  62.12 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  61.48 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  61.92 
 
 		 430 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  60.09 
 
 		 427 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  60.79 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  58.64 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 428 aa  531  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  60.71 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  59.95 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  61.89 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  61.75 
 
 		 432 aa  526  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1722  phosphopyruvate hydratase  60.09 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  61.75 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  62.18 
 
 		 428 aa  524  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  61.61 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  60.97 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  59.86 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  60.97 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  57.74 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0213  phosphopyruvate hydratase  59.16 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  60.09 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  61.06 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  60.14 
 
 		 426 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  60.97 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  60.47 
 
 		 426 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  59.4 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  60.61 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  59.35 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  60.23 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  60.84 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.95 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.2 
 
 		 422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1650  enolase  61.64 
 
 		 448 aa  514  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  60.79 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 		 426 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  60.32 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  60.98 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  58.93 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  58.8 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  59.68 
 
 		 429 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  61.02 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  61.56 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  61.34 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>