More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1119 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.96 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.38 
 
 		 189 aa  208  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.51 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.17 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.85 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  49.43 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  43.78 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  48.92 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.61 
 
 		 219 aa  80.9  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.6 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.45 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  31.63 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.72 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.44 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.94 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.07 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.41 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  23.68 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.32 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  25.52 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  27.17 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  28.35 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.65 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  27.08 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  31.46 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  27.84 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.41 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  26.09 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0442  hypothetical protein  32.69 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  25.54 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  30.22 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.47 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.22 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  25.81 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.26 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.03 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  27.42 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  22.22 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  25.12 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  25.12 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  25.79 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  25.79 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  24.21 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  26.8 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  25.79 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.07 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.02 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  27.72 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  25.7 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  24.14 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.82 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  27.57 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.38 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.49 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.57 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  24.46 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  24.46 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1642  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.61 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  25.7 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  22.84 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  25.14 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0450  multiple drug resistance protein MarC  26.29 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0439205  normal  0.59514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  24.46 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.11 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.11 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.74 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  28.65 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.43 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  27.04 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  25.5 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>