43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0969 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  233  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  46.96 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  43.97 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  42.86 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  43.4 
 
 		 117 aa  85.5  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  43.81 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  42.15 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  38.84 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  40.82 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  39.09 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.38 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  41.23 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  37.14 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  37.27 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  38.68 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  35.45 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  33.05 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  33.93 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  32.43 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  33.64 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  36.89 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  35.51 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0434  hypothetical protein  30.09 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.491399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  33.96 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  34.91 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  35.51 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  32.18 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  34.67 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1790  membrane protein  26.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0469935  hitchhiker  0.000576942 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  32.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  41.89 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  36.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  31.63 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  33.05 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1832  hypothetical protein  32.2 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01390  predicted membrane protein  31.19 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3838  hypothetical protein  34.09 
 
 		 162 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0996285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3912  hypothetical protein  32.95 
 
 		 143 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>