184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1464 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  100 
 
 
180 aa  369  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  58.66 
 
 
190 aa  224  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  55.31 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  57.54 
 
 
186 aa  223  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  55.87 
 
 
187 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  52.25 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  55.31 
 
 
187 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  55.06 
 
 
190 aa  206  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  53.63 
 
 
187 aa  201  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  45.3 
 
 
193 aa  180  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  45.3 
 
 
193 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  41.11 
 
 
180 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  41.11 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  40.56 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  42.54 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  39.78 
 
 
192 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  39.23 
 
 
181 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  42.31 
 
 
157 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  41.67 
 
 
150 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  41.03 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  42.48 
 
 
150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  41.56 
 
 
172 aa  125  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  40.38 
 
 
150 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  36.56 
 
 
198 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  32.96 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  37.16 
 
 
193 aa  97.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  31.84 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  28.11 
 
 
291 aa  95.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  34.08 
 
 
165 aa  94  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  36.42 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  37.91 
 
 
174 aa  92  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  36.54 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  29.38 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  34.19 
 
 
141 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  29.38 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  29.38 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  34.43 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  32.6 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  32.63 
 
 
197 aa  87.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  34.92 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  30.34 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  31.72 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  34.59 
 
 
193 aa  85.1  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  31.98 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  29.83 
 
 
166 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  35.67 
 
 
162 aa  85.1  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  31.98 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  30.39 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  33.99 
 
 
164 aa  84.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2936  carbonic anhydrase  31.82 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  33.77 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1108  carbonic anhydrase  29.8 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2957  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3181  hypothetical protein  31.13 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.58112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3189  hypothetical protein  32.03 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  32.02 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  31.69 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  31.63 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3196  carbonate dehydratase  34.19 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  28.25 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  31.82 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  31.58 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  31.58 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  31.58 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  28.65 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  32.35 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  29.78 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3174  carbonate dehydratase  32.28 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  34.19 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  27.93 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  30.52 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2872  carbonic anhydrase  33.12 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2074  hypothetical protein  30.63 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  28.42 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  26.28 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  26.58 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  29.68 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  28.09 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3188  hypothetical protein  34.29 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  29.81 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  24.58 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  27.67 
 
 
218 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  25.15 
 
 
134 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  22.22 
 
 
272 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  23.67 
 
 
234 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  29.41 
 
 
217 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  25.39 
 
 
217 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  25.13 
 
 
242 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  25.5 
 
 
219 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  23.76 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  23.19 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  25.13 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1090  carbonic anhydrase  24.87 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>