231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0366 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  100 
 
 		 380 aa  790    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  55.97 
 
 		 377 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  53.81 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  52.63 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  49.61 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  50.53 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  51.58 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  49.34 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  48.16 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  48.42 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  48.02 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  49.34 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  48.42 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  48.02 
 
 		 380 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  48.16 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  47.89 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  49.07 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  48.92 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  48.92 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  44.33 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  45.12 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  45.12 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  43.5 
 
 		 398 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  44.06 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  45.21 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  44.68 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  41.75 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  41.76 
 
 		 376 aa  298  8e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  43.51 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  41.94 
 
 		 375 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  40.91 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  40.85 
 
 		 374 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  34.04 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  34.41 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  34.04 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  32.35 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0938  hypothetical protein  33.25 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.493272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  31.9 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1018  putative RNA methylase  34.75 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  32.08 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0180  putative RNA methylase  34.24 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  31.98 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  30.81 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  30.81 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  33.51 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  31.28 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  30.61 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  27.27 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 		 709 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  30.35 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.03 
 
 		 709 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.77 
 
 		 709 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  30.69 
 
 		 385 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.38 
 
 		 713 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.77 
 
 		 709 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  32.38 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 		 738 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.11 
 
 		 711 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  28.28 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.01 
 
 		 711 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  31.13 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.75 
 
 		 709 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  29.37 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.34 
 
 		 711 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.49 
 
 		 713 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.49 
 
 		 713 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.49 
 
 		 713 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.41 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  29.23 
 
 		 387 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  31.23 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0018  putative RNA methylase  30.81 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000217625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  30.95 
 
 		 380 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28 
 
 		 721 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.95 
 
 		 712 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.47 
 
 		 711 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.97 
 
 		 711 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.08 
 
 		 708 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2415  putative RNA methylase  31.72 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0460836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  27.34 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.96 
 
 		 705 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  31.28 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.73 
 
 		 711 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.17 
 
 		 725 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.16 
 
 		 708 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  27.09 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.36 
 
 		 718 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.51 
 
 		 749 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  27.42 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  29.81 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.99 
 
 		 725 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.83 
 
 		 705 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.97 
 
 		 730 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.13 
 
 		 712 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>