More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0165 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  619  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  23.57 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.39 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  23.77 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  24.58 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  41.82 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  40.91 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  24.35 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3144  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  35.11 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  23.47 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  25.88 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  23.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  23.47 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  25.88 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  23.47 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  27.66 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  27.66 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  28.39 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2396  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  20.95 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2360  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000555626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2592  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00912873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  26.84 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2326  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  26.51 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2406  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2582  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2772  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320342  decreased coverage  0.000000000118835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>