More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2562 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
92 aa  193  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  71.74 
 
 
92 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  67.03 
 
 
97 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  63.83 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  71.05 
 
 
94 aa  130  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  60.71 
 
 
86 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  60.92 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1737  protein of unknown function DUF37  62.86 
 
 
71 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  51.32 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  51.9 
 
 
86 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002015  YidD  53.52 
 
 
85 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  45 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  46.51 
 
 
107 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
75 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4862  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  41.76 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  49.28 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0830  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  43.37 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2412  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  84.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6076  hypothetical protein  53.73 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0967401  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27020  conserved hypothetical protein TIGR00278  49.35 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  46.67 
 
 
76 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13957  hypothetical protein  54.69 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  41.46 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  41.46 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  39.51 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  51.52 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  55.07 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  49.25 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  42.68 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  50.75 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  41.98 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  43.9 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  56.06 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  53.12 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  53.97 
 
 
72 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  48.72 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  45.33 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  45.33 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  50.72 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  51.32 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.72 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5787  hypothetical protein  53.12 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.702755  normal  0.0165657 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  44.58 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5411  hypothetical protein  53.12 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0006  hypothetical protein  53.12 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814058  normal  0.0634451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  48.57 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.56 
 
 
136 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3467  hypothetical protein  47.62 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  46.67 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  48.68 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  46.38 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  46.99 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  53.12 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  51.47 
 
 
89 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1785  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0219614  normal  0.264154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  47.14 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  46.48 
 
 
81 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  45.71 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  47.44 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  43.75 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  45.71 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  45.71 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  45.71 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  39.51 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4222  hypothetical protein  48.53 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105807  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.83 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  45.71 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>