More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1645 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  75.79 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  75.4 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  75.79 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  76.21 
 
 		 301 aa  384  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 		 272 aa  323  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  31.47 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  31.47 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  31.47 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  31.47 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 785 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 495 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  34.13 
 
 		 479 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  32.9 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  33.81 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  33.81 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  33.85 
 
 		 353 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  34.29 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 		 205 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  33.49 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  33.49 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  34.68 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  32.73 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  28.06 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  29.41 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  28.96 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  28.96 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  29.11 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  29.11 
 
 		 196 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  29.11 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02257  putative transposase  30.26 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01833  putative transposase  30.26 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01835  putative transposase  30.26 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  28.48 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  28.48 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02618  putative transposase  30.26 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  33.33 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  27.36 
 
 		 295 aa  85.1  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2958  ISCps3, transposase orfB  27.36 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  28.66 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>