More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0695 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
272 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 
280 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
271 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
282 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
273 aa  171  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  39.06 
 
 
255 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  39.06 
 
 
255 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  39.19 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
306 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  33.58 
 
 
296 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
633 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
279 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
274 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  30.4 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  29.23 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
615 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
338 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  27.72 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
361 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.93 
 
 
330 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
347 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
363 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
340 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
339 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
336 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.78 
 
 
341 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
333 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
336 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
327 aa  98.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  26.84 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
338 aa  95.5  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
367 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
334 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
352 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
347 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
364 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
365 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  28.23 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
267 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
373 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
308 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
1250 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.3 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
322 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  33.74 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.05 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.05 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.17 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
345 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.85 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
544 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  26.36 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
336 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.37 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
1032 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.62 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0511045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>