88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1429 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  79.1 
 
 		 135 aa  228  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  80.45 
 
 		 135 aa  228  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  71.97 
 
 		 181 aa  204  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  73.48 
 
 		 133 aa  203  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  73.44 
 
 		 132 aa  203  6e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  75.4 
 
 		 134 aa  202  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  57.78 
 
 		 134 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  56.3 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  56.49 
 
 		 135 aa  147  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  55.73 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  53.85 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  48.41 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  53.64 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  40.48 
 
 		 735 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  36.67 
 
 		 732 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  36.51 
 
 		 742 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  36.51 
 
 		 742 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  36.51 
 
 		 742 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  36.51 
 
 		 728 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  35.71 
 
 		 729 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  35.71 
 
 		 729 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  35.71 
 
 		 729 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  35.48 
 
 		 727 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  39.37 
 
 		 728 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  35.71 
 
 		 729 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  38.52 
 
 		 728 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  35.71 
 
 		 728 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  35.71 
 
 		 728 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  36.51 
 
 		 728 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  38.58 
 
 		 728 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  37.9 
 
 		 734 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  38.58 
 
 		 728 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  37.61 
 
 		 728 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  35.71 
 
 		 728 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  35.66 
 
 		 728 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 728 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  37.1 
 
 		 731 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  34.92 
 
 		 728 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  34.13 
 
 		 728 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  36.29 
 
 		 734 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  35.48 
 
 		 734 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  36.75 
 
 		 734 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  33.6 
 
 		 734 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  27.91 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  25.78 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  28.35 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  25.19 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  29.51 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  28.04 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  25.74 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  24.37 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  27.62 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  27.62 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  27.62 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  22.22 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  27.03 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  23.26 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  30.39 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  27.62 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  27.62 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  26.5 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  27.62 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  27.1 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  27.35 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4617  OsmC family protein  28.44 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  24.71 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0232  OsmC family protein  25.88 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1605  OsmC family protein  27.27 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0376  hypothetical protein  25.88 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  34.85 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1613  OsmC family protein  26.61 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  30.68 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1531  OsmC family protein  35.44 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  26.83 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  24.42 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  30.38 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  22.73 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  26.6 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  22 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  40.43 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  33.82 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  29.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2951  OsmC-like protein  29.03 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000581038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  33.87 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  28.85 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  27.78 
 
 		 409 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>