152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1110 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 113 aa  206  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  81.08 
 
 		 113 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  69.64 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  67.62 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  67.27 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  69.03 
 
 		 138 aa  127  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  64.6 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  53.85 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  52.78 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  52.88 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  49.04 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  48.08 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  51.46 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  45.95 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  45.19 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  49.02 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  49.53 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  48.04 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  45.19 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  43.52 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  55.34 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  43.93 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  49.17 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  41.24 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  45 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  39.81 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  50.98 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  47.42 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  44.34 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0171  membrane hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  45.26 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  48.57 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  48.65 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  46.15 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  45.79 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  39.82 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  45.05 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  45.45 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  44.14 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  44.14 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  46.85 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  56.94 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  47.06 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  41.41 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  43.3 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  52.56 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  38 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  41.67 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  45.88 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4992  membrane protein of unknown function  42.72 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  44.12 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  43.01 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  41.23 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  39.67 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  41.67 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0185  membrane protein of unknown function  45.37 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  39.08 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  45.68 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  42.53 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  38.74 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  39.09 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  43.48 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  40.54 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  40.17 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  40 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  41.3 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  49.02 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  38.64 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  43.02 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  38.18 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  41.18 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  41.49 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  40.2 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3334  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3657  membrane protein of unknown function  47.12 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1700  membrane protein of unknown function  48.15 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3113  membrane protein of unknown function  46.02 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00902267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  37.37 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>