64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1363 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  693    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  54.08 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  53.52 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  52.96 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  41.16 
 
 		 354 aa  288  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  40.56 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  41.13 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  38.42 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  31.64 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.81 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  22.03 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  22.93 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  21.73 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  25.1 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  19.67 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  22.47 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  31.82 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.03 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.3 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  23.01 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  20.08 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  23.51 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  23.51 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  24.52 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.89 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  20 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  22.19 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  18.37 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  23.36 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.18 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  22.01 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  22.22 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  19.4 
 
 		 1153 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  20.69 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.6 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 362 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  20.77 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  21.77 
 
 		 364 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>