170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1011 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 390 aa  750    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  52.73 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1061  putative transmembrane transport protein  55.7 
 
 		 159 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.4 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  31.44 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  31.04 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  30.48 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  29.91 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 361 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  28.69 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  27.79 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  28.12 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  29.21 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  30.75 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  30 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  27.83 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  28.95 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  28.95 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  28.95 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  28.95 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  28.95 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.68 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 496 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.68 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  29.14 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  28.11 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  29.07 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  28.88 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  28.61 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  28.76 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  28.61 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 408 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  28.42 
 
 		 424 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  29.19 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  27.6 
 
 		 421 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0190  cyanate permease  28.14 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 405 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  29.32 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  28.08 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  29.06 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  26.67 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  30.47 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  26.4 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1059  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.845777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  25.74 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  26.26 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  26.26 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  26.16 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  26.16 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  26.26 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  26.26 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  25.32 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>