More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0608 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0608  rod shape-determining protein  100 
 
 		 369 aa  731    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1417  rod shape-determining protein RodA, putative  77.32 
 
 		 366 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1297  rod shape-determining protein RodA, putative  77.32 
 
 		 366 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0473  rod shape-determining protein RodA  68.02 
 
 		 368 aa  512  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.936553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1222  cell cycle protein  68.29 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0638  cell cycle protein  67.21 
 
 		 368 aa  490  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0511  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  68.67 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1290  cell cycle protein  62.36 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0782  cell cycle protein  60.11 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0209575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  36.13 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.37 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  36.13 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  39.06 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.73 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  38.56 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.53 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 370 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 		 368 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.37 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.21 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.99 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  38.93 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  38.93 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  38.93 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  39 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  36.13 
 
 		 370 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  38.94 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35.85 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  38.59 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.81 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  35.89 
 
 		 361 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  33.07 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  38.18 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  32.51 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  36.6 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  41.61 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  40.13 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  34.63 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  38.61 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  33.06 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.77 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  35.82 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04258  rod shape-determining protein RodA  31.71 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239433  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  35.92 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 		 380 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  32.89 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  37.84 
 
 		 381 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  32.89 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.7 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  33.98 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  35.39 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  32.35 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  33.97 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  34.29 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  32.35 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  34.47 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  35.39 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  34.47 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  32.35 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  32.8 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  34.94 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 362 aa  173  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.15 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  37.2 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  36.13 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  35.87 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  32.8 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  34.26 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  36.15 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  36.15 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.76 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  36.15 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>