More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0638 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0638  cell cycle protein  100 
 
 		 368 aa  733    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0473  rod shape-determining protein RodA  72.33 
 
 		 368 aa  557  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.936553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1222  cell cycle protein  70.41 
 
 		 368 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0608  rod shape-determining protein  67.21 
 
 		 369 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0511  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  70.91 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1297  rod shape-determining protein RodA, putative  65.64 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1417  rod shape-determining protein RodA, putative  65.64 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1290  cell cycle protein  62.33 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0782  cell cycle protein  59.67 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0209575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  35.75 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  36.42 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  39.94 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  39.05 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  36.5 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  36.1 
 
 		 379 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  38.65 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  35.04 
 
 		 365 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 376 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.51 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  36.33 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  37.13 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  38.64 
 
 		 374 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  35.85 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  37.13 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  36.96 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  36.33 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  36.33 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  36.59 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.73 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  34.72 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  39.12 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  37.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  35.29 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  37.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  37.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  35.29 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  37.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  37.94 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  35.29 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  37.75 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  35.9 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  37.07 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  35.22 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.35 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.08 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.85 
 
 		 370 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 		 367 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33.24 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  32.42 
 
 		 383 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  38.51 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  31.45 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  32.17 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.42 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.42 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  35.77 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.63 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2191  rod shape-determining protein RodA  38.52 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  35.99 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>