168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0573 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0863  phosphatidylserine decarboxylase  64.93 
 
 		 266 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0934  phosphatidylserine decarboxylase  64.18 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0997  phosphatidylserine decarboxylase  63.43 
 
 		 266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.597976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1320  phosphatidylserine decarboxylase  53.38 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00632979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1384  phosphatidylserine decarboxylase  52.99 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1154  phosphatidylserine decarboxylase  49.62 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0928124  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1554  phosphatidylserine decarboxylase  51.11 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0749  phosphatidylserine decarboxylase  42.86 
 
 		 295 aa  215  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1033  phosphatidylserine decarboxylase  45.19 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.339305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  32.79 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  31.01 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  31.75 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  29.85 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  34.96 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  31.35 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  34.55 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  31.82 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  31.89 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  34.33 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  33.78 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  31.3 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  34.02 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  32.5 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  32.69 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  29.25 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  30.89 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  33.89 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  32.3 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  33.89 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  33.89 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  30.58 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  33.89 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  32.08 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  31.56 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  32.2 
 
 		 296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  29.44 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  33.21 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  32.9 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  31.98 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  31.36 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  30.25 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  28.87 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  29.39 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  30.8 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  30.74 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  29.39 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  32.78 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  32.78 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  33.48 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  32.3 
 
 		 307 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  31.67 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  32.59 
 
 		 345 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  29.67 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  34.32 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 322 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  31.7 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.21 
 
 		 610 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  32.37 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  29.64 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  29.29 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  31.18 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  29.55 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  32.44 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.51 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  29.67 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  32.14 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  29 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  28.45 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  29.63 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  28.4 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>