More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2712 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07420  NADH dehydrogenase subunit E  73.72 
 
 
319 aa  391  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0368218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0473  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  76.36 
 
 
302 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3225  NADH dehydrogenase subunit E  64.26 
 
 
283 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0065484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0543  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  64.52 
 
 
269 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.727219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0285  NADH-quinone oxidoreductase subunit E  69.63 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4414  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  69.63 
 
 
240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0588  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit- like protein  65.42 
 
 
219 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5057  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  67.77 
 
 
248 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.941311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2691  NADH dehydrogenase subunit E  67.3 
 
 
239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13170  NADH dehydrogenase subunit E  61.99 
 
 
252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0271  NADH dehydrogenase subunit E  63.64 
 
 
269 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0524  NADH dehydrogenase subunit E  59.83 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4485  NADH dehydrogenase subunit E  63.43 
 
 
287 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256998  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1881  NADH dehydrogenase subunit E  60.18 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.54783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1576  NADH dehydrogenase subunit E  61.99 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1600  NADH dehydrogenase subunit E  61.99 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.737975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1546  NADH dehydrogenase subunit E  61.54 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.132733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7687  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  68.13 
 
 
228 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4459  NADH dehydrogenase subunit E  59.11 
 
 
305 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4061  NADH dehydrogenase subunit E  58.22 
 
 
317 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732889  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0542  NADH dehydrogenase subunit E  57.96 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542965  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1278  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  58.29 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.468909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03200  NADH dehydrogenase subunit E  57.6 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3172  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  62.18 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.84 
 
 
706 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6678  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  56.19 
 
 
254 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6090  NADH dehydrogenase subunit E  57.49 
 
 
273 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4554  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  57.14 
 
 
341 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0978  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  54.3 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0367  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  46.05 
 
 
208 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76559  subunit NUHM of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase  33.02 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.261149  normal  0.246661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1873  NADH-quinone oxidoreductase E subunit  41.55 
 
 
188 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1312  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  43.7 
 
 
160 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4084  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.14 
 
 
165 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1320  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.86 
 
 
174 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3631  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.22 
 
 
170 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1045  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.97 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1267  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.28 
 
 
175 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3674  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.16 
 
 
174 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1279  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.02 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2703  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  39.72 
 
 
151 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_002978  WD0734  NADH dehydrogenase subunit E  36.49 
 
 
166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0247603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5102  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.29 
 
 
166 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06077  NADH-ubiquinone oxidoreductase 24 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  39.46 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2210  NADH dehydrogenase subunit E  41.52 
 
 
167 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2156  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.26 
 
 
224 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1887  NADH dehydrogenase subunit E  41.52 
 
 
167 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.15689  normal  0.768651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2626  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.13 
 
 
163 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2253  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.13 
 
 
163 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1559  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.66 
 
 
208 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2058  NADH dehydrogenase subunit E  45.53 
 
 
167 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174503  normal  0.0716989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7015  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.93 
 
 
161 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5176  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.79 
 
 
163 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0482  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.11 
 
 
162 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.220464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4349  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.41 
 
 
188 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0712  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  40.56 
 
 
176 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0338  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.03 
 
 
165 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4068  NADH dehydrogenase subunit E  46.49 
 
 
157 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50582  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07090  conserved hypothetical protein  37.58 
 
 
249 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0210016  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_7050  predicted protein  33.86 
 
 
217 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000378621  hitchhiker  0.000000494703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1497  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  41.06 
 
 
162 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.358345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3927  formate dehydrogenase subunit gamma  40.69 
 
 
159 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4078  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  35.53 
 
 
170 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.352325  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0931  NADH dehydrogenase subunit E  44.72 
 
 
168 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.394875  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0913  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
203 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0965  NADH dehydrogenase subunit E  44.72 
 
 
168 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489365  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0427  NADH dehydrogenase subunit E  35.29 
 
 
180 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.835091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1614  NADH dehydrogenase (ubiquinone), E subunit  38.89 
 
 
174 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.476217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2236  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  36.62 
 
 
163 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0549  NADH-quinone oxidoreductase chain E  38.89 
 
 
174 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3134  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  33.78 
 
 
171 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0282366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0697  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
157 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000280605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0721  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.5 
 
 
157 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000389921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1095  NADH dehydrogenase subunit E  42.28 
 
 
158 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.236534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2809  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.35 
 
 
165 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0961  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
163 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643352 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0615  NADH dehydrogenase subunit E  34.42 
 
 
181 aa  102  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0737387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3210  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
161 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0876  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  38.71 
 
 
163 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0108  hypothetical protein  35.19 
 
 
377 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.996331  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0636  NADH dehydrogenase subunit E  36.81 
 
 
181 aa  101  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2899  formate dehydrogenase subunit gamma  39.26 
 
 
159 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4130  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.01 
 
 
385 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2005  NADH dehydrogenase subunit E  42.86 
 
 
161 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583559  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3638  formate dehydrogenase subunit gamma  38.62 
 
 
159 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06310  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.58 
 
 
162 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000454733  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22919  predicted protein  33.11 
 
 
260 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  36.17 
 
 
173 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5573  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0826314  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2162  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2283  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1428  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  37.59 
 
 
165 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.464968  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1633  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2269  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.128082  normal  0.14114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2245  NADH dehydrogenase subunit E  41.27 
 
 
161 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254081  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  35.77 
 
 
158 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4740  NADH dehydrogenase subunit E  38.96 
 
 
162 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3083  NADH-quinone oxidoreductase, E subunit  39.13 
 
 
174 aa  99  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0953  NADH dehydrogenase subunit E  43.9 
 
 
157 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.544073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>