More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3108 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
400 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.7 
 
 
407 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.95 
 
 
407 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.21 
 
 
407 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  53.96 
 
 
407 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  54.21 
 
 
407 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  53.96 
 
 
407 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  53.96 
 
 
407 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.59 
 
 
393 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  55.86 
 
 
405 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.59 
 
 
393 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  53.88 
 
 
407 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.89 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.89 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.39 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.64 
 
 
399 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  55.64 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.64 
 
 
399 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  54.06 
 
 
408 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.64 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  55.64 
 
 
399 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  55.14 
 
 
399 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  55.39 
 
 
399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  52.14 
 
 
412 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  53.69 
 
 
411 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  38.13 
 
 
399 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  34.16 
 
 
403 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  32.03 
 
 
403 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 
400 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
436 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.82 
 
 
587 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
409 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
586 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 
585 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
394 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 
586 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.53 
 
 
587 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 
393 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
586 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.55 
 
 
585 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
586 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.38 
 
 
585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 
585 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
587 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  31.95 
 
 
585 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  30 
 
 
385 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  31.8 
 
 
393 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  33.23 
 
 
415 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
388 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
757 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.78 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 
384 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 
401 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 
384 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
387 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  28.01 
 
 
395 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
388 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 
586 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 
664 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 
404 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 
777 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.47 
 
 
741 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  28.84 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 
395 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 
373 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
745 aa  123  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  32.42 
 
 
662 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
775 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 
747 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
741 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 
581 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 
567 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.51 
 
 
567 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  29.25 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  28.72 
 
 
555 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 
381 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 
654 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  26.48 
 
 
408 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
441 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 
710 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
671 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.65 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.65 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.65 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.65 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.27 
 
 
562 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.39 
 
 
375 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  25.43 
 
 
583 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.39 
 
 
375 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 
773 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>