More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3880 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  100 
 
 		 386 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  67.53 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  69.19 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  64.51 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  66.49 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  64.01 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  61.92 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  63.24 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  61.76 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  59.48 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  61.13 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  62.93 
 
 		 401 aa  345  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  62.67 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  52.36 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  56.25 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 		 384 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 384 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 		 384 aa  288  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  48.53 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  56.77 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  51.6 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  39.79 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  37.12 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  36.15 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.89 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.89 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.63 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.63 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.63 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  32.36 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.1 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.1 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  35.25 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  31.71 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  31.46 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.83 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.46 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.56 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.83 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.46 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.46 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.56 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 747 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  32.4 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 757 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 741 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 782 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.36 
 
 		 587 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 586 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 741 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.59 
 
 		 587 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.65 
 
 		 585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 586 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  29.4 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 745 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 		 585 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 771 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  26.97 
 
 		 585 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 567 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 567 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 		 656 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.26 
 
 		 588 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.92 
 
 		 664 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 		 585 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  33.45 
 
 		 710 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.95 
 
 		 567 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.51 
 
 		 720 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  29.28 
 
 		 562 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 777 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.73 
 
 		 666 aa  90.1  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.65 
 
 		 671 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 631 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 		 764 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 657 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.95 
 
 		 648 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 653 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 762 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 		 598 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  28.27 
 
 		 649 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  27.41 
 
 		 650 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>