More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2651 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 373 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  67.56 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  67.29 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  67.29 
 
 		 384 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  61.39 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  51.5 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  50.13 
 
 		 436 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  55.35 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  50.27 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  52.53 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  58.77 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  51.87 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  52.14 
 
 		 401 aa  262  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  50.4 
 
 		 388 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  49.74 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  49.47 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  46.74 
 
 		 393 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  50.4 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  50.54 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  46.2 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  47.25 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.69 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.33 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.01 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.75 
 
 		 407 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 407 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.48 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.48 
 
 		 407 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.48 
 
 		 407 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  36.13 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  28.91 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  32.74 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.28 
 
 		 741 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 747 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  29.84 
 
 		 771 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 		 782 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 585 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.41 
 
 		 666 aa  96.3  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.62 
 
 		 587 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 587 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.71 
 
 		 543 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 586 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.92 
 
 		 585 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 586 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 659 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 586 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 745 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 664 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  28.77 
 
 		 662 aa  92.8  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 586 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.11 
 
 		 587 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 586 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 585 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.45 
 
 		 654 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 674 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 757 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.18 
 
 		 585 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 764 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 777 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.36 
 
 		 585 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  27.42 
 
 		 666 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 		 581 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.1 
 
 		 741 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 775 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  29.89 
 
 		 660 aa  87  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  27.82 
 
 		 652 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 		 741 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 667 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  31.61 
 
 		 661 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  27.34 
 
 		 649 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  30.11 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  30.22 
 
 		 673 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 567 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>