More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0363 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
414 aa  786    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  60.66 
 
 
427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 
403 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  37.23 
 
 
408 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.53 
 
 
407 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.77 
 
 
407 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
407 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.53 
 
 
407 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  34.53 
 
 
407 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.81 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.81 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.05 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.65 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.38 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.62 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 
407 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.14 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.14 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
399 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.1 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.1 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.1 
 
 
399 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  34.85 
 
 
399 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  36.43 
 
 
403 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  34.85 
 
 
399 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 
405 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 
412 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 
436 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  36.19 
 
 
409 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 
411 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 
393 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.16 
 
 
386 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  39.04 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  38.9 
 
 
401 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 
388 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.37 
 
 
415 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 
396 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  37.87 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  36.34 
 
 
385 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
388 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 
395 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
384 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 
384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  32.91 
 
 
384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 
710 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.54 
 
 
585 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.54 
 
 
585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.55 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.23 
 
 
587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
741 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 
585 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.85 
 
 
587 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 
373 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
587 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 
673 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
586 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 
586 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
408 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  28.9 
 
 
650 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 
586 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 
671 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 
757 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 
586 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
586 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  31.52 
 
 
558 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
652 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  27.51 
 
 
747 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
777 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.47 
 
 
558 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  32.47 
 
 
558 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  32.47 
 
 
558 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  32.47 
 
 
558 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  32.18 
 
 
558 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  32.18 
 
 
558 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  32.18 
 
 
558 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  32.47 
 
 
558 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  30.87 
 
 
649 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 
657 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  31.9 
 
 
558 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  30.03 
 
 
387 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  31.9 
 
 
558 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  31.9 
 
 
558 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  31.9 
 
 
558 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  31.9 
 
 
558 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  29.75 
 
 
387 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  27.43 
 
 
650 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  29.75 
 
 
387 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  29.46 
 
 
387 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  29.75 
 
 
387 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>