More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1518 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 411 aa  797    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  85.15 
 
 		 405 aa  641    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  78.08 
 
 		 408 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.33 
 
 		 407 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.33 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.5 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.48 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.5 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  61.33 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  64.25 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  60.84 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  61.58 
 
 		 407 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.33 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.5 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.48 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.58 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.48 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  64.74 
 
 		 399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  64.25 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  61.08 
 
 		 407 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  64.23 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  62.34 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  62.34 
 
 		 393 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  53.69 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  41.91 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  39.31 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  40.63 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.92 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 585 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 585 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  32.85 
 
 		 409 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 		 436 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  33.71 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.42 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 586 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 		 586 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.17 
 
 		 587 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 586 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 587 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.46 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  27.46 
 
 		 585 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.1 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.87 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  30.67 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 586 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 747 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 741 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  31.51 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 745 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.08 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 567 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 782 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 757 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.37 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 		 441 aa  120  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 664 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  31.52 
 
 		 562 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 710 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  30.71 
 
 		 658 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 771 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 777 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  28.31 
 
 		 720 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 		 775 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  29.31 
 
 		 561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  28.19 
 
 		 563 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  29.43 
 
 		 649 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  29.31 
 
 		 561 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 656 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  30.29 
 
 		 583 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 671 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  28.95 
 
 		 649 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.31 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  29.39 
 
 		 558 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  29.39 
 
 		 558 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>