More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0232 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 412 aa  798    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  69.63 
 
 		 407 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  69.63 
 
 		 407 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  68.64 
 
 		 407 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  69.63 
 
 		 407 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  69.38 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  69.63 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  69.14 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  71.03 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  68.15 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  71.03 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  70.78 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  70.78 
 
 		 399 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  71.03 
 
 		 399 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  71.03 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  71.03 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  71.03 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  70.53 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  70.78 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  69.97 
 
 		 393 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  69.97 
 
 		 393 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  57.67 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  58.66 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  58.09 
 
 		 411 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  52.14 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.04 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.04 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  38.4 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  28.68 
 
 		 585 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  31.65 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 585 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  32.96 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  32.57 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 393 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 777 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 587 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.43 
 
 		 587 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.62 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  31.47 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 586 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 586 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  32.03 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  26.71 
 
 		 585 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  26.48 
 
 		 585 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  32.42 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 587 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 741 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 384 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 		 664 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 757 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 782 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.32 
 
 		 741 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 745 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  28.19 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 		 586 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 747 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 764 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 656 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  28.06 
 
 		 555 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 741 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 666 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 710 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.56 
 
 		 562 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  26.61 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  27.93 
 
 		 663 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 771 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.51 
 
 		 669 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.52 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.59 
 
 		 648 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.05 
 
 		 375 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  27.59 
 
 		 663 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>